Das liebste Hobby des 17-jährige Oberschülers Shinichi Kudo ist die Auflösung von Verbrechen. Dabei hat er schon mehr als einmal der Polizei wertvolle Dienste geleistet.
Doch während eines gefährlichen Einsatzes wird Shinichi überrascht und von hinten niedergeschlagen. Die Verbrecher beschließen ihn mit einem neuen Gift zu töten. Sie flößen es ihm ein und verschwinden. Doch anstatt das es ihn töten bewirkt das Gift das Shinichi zu einen kleinen Jungen geschrumpft wird.

Um seine Freunde nicht zu gefährden beschließt Shinichi sich eine neue Identität zuzulegen. Ab jetzt nennt er sich Conan Edogawa. Conan nach dem berühmten Schriftsteller der Sherlock Holmes Bücher und Edogawa nach einem japanischen Schriftsteller.
Als kleiner Junge lebt er fortan bei seinem Jugendschwarm Ran Mori und deren Vater Kogoro. Da dieser ein Detektiv ist löst Conan von nun an in dessen Namen weiterhin Verbrechen auf. Dabei ist er aber immer auf der Suche nach den Männern in Schwarz.

Ran und Shinichi kennen sich schon seit Kindertagen. Heimlich ist sie ihn verliebt, doch zu ihrem Leidwesen hat Shinichi (fast) nichts außer Sherlock Holmes im Kopf. Als Shinichi verschwindet nimmt sie den kleinen Conan bei sich auf. Ohne zu wissen das dieser Shinichi ist vertraut sie ihm an das sie in ihn verliebt ist.Seit sich ihre Mutter von Kogoro getrennt hat lebt sie zusammen mit ihrem Vater in Tokyo. Sie betreibt als Hobbys Karate und ist in ihrer Schule sogar Captain der Karatemannschaft.
Mehr als einmal ist Ran kurz davor Conans wahre Identität aufzudecken, doch bisher konnte sich conan/Shinichi immer im letzten Moment retten.

Rans Vater war früher bei der Polizei. Doch nachdem er bei einem Einsatz versehentlich seine Frau angeschossen hatte, wurde er suspendiert. Danach wurde er als Privatdetektiv tätig. Wenn auch mehr schlecht als recht. Die Tatsache das er sehr dem Alkohol zugetan ist hilft dabei nicht gerade.
Doch als Conan bei ihm auftaucht ändert sich einiges. Auf einmal löst Kogoro alle seine Fälle und wird als der Detektiv der seine Fälle im Schlaf löst bekannt.
Sein größter Schwarm ist die Schauspielerin und Sängerin Yoko Okino.